个体户注销营业执照的程序如下：
1、先将公司银行账户中的钱全部转走，进行银行销户，须携带开户的所有资料，包括营业执照正副本，税务登记证正副本，银行开户许可证，机构信用代码证，法人身份证和经办人身份证原件及复印件，公章，财务专用章，名章。
2、如果有未开具的空白发票，先在开票系统中将未开具的空白发票进行作废。
3、带着发票领购簿和未开具的空白发票到税务局进行验票，没有问题后，税务局会收回发票领购簿并告知回去对金税盘进行修改时钟，并进行抄当月税，具体的流程可以咨询当地的金税盘服务企业。
4、金税盘修改好时钟，完成抄税后，携带金税盘，税务登记证正副本，公章，对金税盘和税务登记进行注销，税务局受理后3-5个工作日会出具税务事项通知书予以核准注销。
5、携带营业执照正副本、和税务局出具税务事项通知书原件及复印件、公章到工商局注销营业执照。
6、这样个体户就成功注销掉营业执照了。
注意：个体工商户营业执照遗失或毁损的，可通过国家企业信用信息公示系统或本市市场主体信用公示系统进行公示公告声明作废，无需在报纸上登载声明作废公告，节约注销费用。