猪巴尔通体病与猪附红细胞体病在临床症状上极为相似，易于混淆，其鉴别要点是:猪附红细胞体多寄生于红细胞表面，血浆中的附红细胞体碰到红细胞后附着其上不再运动，附红细胞体不能在普通培养基上生长繁殖。而巴尔通体除寄生在红细胞和血浆中外，还能生存在肝细胞、白细胞和粪便、尿液中，遇到红细胞不附着仍可运动，在普通培养基上可生长繁殖。